بررسی عبور پلیمر از داخل حفره

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه
  • نویسنده سمیرا سادات مهدوی
  • استاد راهنما فریناز روشنی
  • تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
  • سال انتشار 1391
چکیده

پدیده ی عبور مولکول های زیست-پلیمری از حفره های غشایی یکی از پدیده های حیاتی در شیمی و زیست فناوری محسوب می شود. درک فیزیک این پدیده راه را برای توالی یابی ژنوم از طریق عبور دادن مولکول های‎ dna ‎‎از حفره هایی با ابعاد مناسب فراهم می سازد. یکی از عوامل موثر روی پدیده ی عبور بر هم کنش های هیدرودینامیک می باشد که ما در این پایان نامه به آن پرداخته ایم. در این پایان نامه از نرم افزار دینامیک مولکولی‎ ‎lammps‎ ‎ برای شبیه سازی پدیده ی عبور مولکول ‎‎dna‎‎‎ تک رشته ای از یک حفره ی مصنوعی با اعمال یک نیروی ثابت در ناحیه حفره استفاده شده است. برای حالت بدون حضور سیال به طور صریح، حرکت پلیمر به وسیله ی تکنیک دینامیک سه بعدی لانژوین و برهم کنش های هیدرودینامیک میان پلیمر و سیال صریح به وسیله ی روش مبتنی بر ذره دینامیک دوران تصادفی شبیه سازی شده است. رابطه ی میان زمان عبور با طول پلیمر و نیروی محرک برای دو حالت با و بدون در نظر گرفتن اثرات برهم کنش های هیدرودینامیک محاسبه شد. در نهایت مشاهده شد که برهم کنش های هیدرودینامیک فرایند عبور زنجیره ی مولکولی را تسهیل می کند و هر چه پلیمر طویل تر باشد نسبت به زنجیره ی کوتاه تر زمان کمتری برای عبور از حفره نیاز دارد‎.‎

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

شرایط مرزی برپایه مشخصه‌ها برای تحلیل جریان تراکم ناپذیر داخل کانال در عبور از پله

نحوه اعمال شرایط مرزی در روش های حل عددی به دلیل تاثیر مستقیم بر دقت جوابها و سرعت همگرایی، از اهمیت زیادی برخوردار است. در جریانهای تراکم ناپذیر لزج، به دلیل شرط عدم لغزش روی مرزهای جامد، مولفه های سرعت روی این مرزها صفر است و فشار روی مرز با استفاده از برونیابی سلول های نزدیک مرز به دست می آید. در مقاله حاضر روش جدیدی برمبنای مشخصه های معادلات برای تخمین فشار در روی مرزهای جامد ارائه شده ...

متن کامل

مطالعه عبور پلیمر انعطاف پذیر از یک غشای نامتقارن

انتقال پلیمر از حفره ای با قطر قابل مقایسه با قطر پلیمر در سال های اخیر مورد توجه فیزیک دانان ماده چگال نرم قرار گرفته است. بسیاری از جنبه های انتقال پلیمر از حفره های باریک مستقل از جزئیات ساختاری پلیمر و حفره بوده و به ماهیت درشت مولکولی پلیمر مربوط می شوند. در این پایان نامه، انتقال پلیمر از حفره ای در یک غشای نامتقارن به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار می گیرد. عدم تقارن غشا...

15 صفحه اول

بررسی عبور امواج نامنظم از موج‌شکن‌های شکل‌پذیر

موج‌شکن شکل‌پذیر نوعی موج‌شکن توده‌سنگی است که نیمرخ آن پس از برخورد از امواج طراحی به یک نیمرخ تعادلی تبدیل می‌شود. در این تحقیق، اثر پراسنجه‌های موج شامل ارتفاع موج شاخص، دوره‌های تناوب میانگین و چکادی، و مدت توفان، و پراسنجه‌های سازه‌ای مانند ژرفای آب در پای سازه، شیب اولیه سازه، نفوذپذیری و ضریب دانه‌بندی بر ضریب عبور امواج نامنظم از موج‌شکن‌های شکل‌پذیر مورد مطالعه و بررسی قرار گرفته است. ...

متن کامل

عبور از گدروزیا

اسکندر مقدونی در سال 325 ق.م. در دهانه رود سند تصمیم به بازگشت به غرب را گرفت. در نقشه ترسیمی وی سپاه بزرگ مقدونی که اینک از ملیت­های مختلف تشکیل شده بود، به فرماندهی خود وی از طریق سواحل گدروزیا (دریای عمان) سفر جنگی خود را آغاز نمود، در حالی که ناوگان دریایی او به سرکردگی نئارخوس در آبهای این دریا نیروی زمینی را حمایت می­کرد. جغرافیانگاران یونانی در این عهد بلوچستان را به سه بخش به نامهای اور...

متن کامل

بررسی تاثیر لیدوکائین و بوپیواکائین داخل حفره شکمی بر شدت درد و علائم بیماران بعد از هیسترکتومی ابدومینال

Background and purpose: Post operation pain is seen in 30-70 percent of patients. Using local anesthetic is a safe, easy and cheap method for post opration pain management. In this study, the effects of lidocaine and bupivacaine lavage on post operation pain are assessed. Materials and Methods: In this double blind randomized control clinical trial, 90 healty women between 15-60 years old ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023